Anal fistülde olası apse odakları yok etmek için aşamalı tedavi her zaman için çok daha uygun bir yaklaşımdır. (Özellikle de tekrarlama riskini azaltmak için) Bu çerçevede uygun hastalarda ilk aşamada gevşek seton uygulaması yapılarak olası apse/ enfeksiyon varlığı ekarte edilir. Bu süreç sıklıkla 6-8 haftayı kapsar. (ki bu Sonrasında ikinci bir ameliyata alınır ve gerek hastalığın gerekse cerrahın tecrübesi doğrultusunda lazerle yakma veya LİFT gibi makat kaslarına zarar vermeyen yöntemlerle ilerlenir. Ya da baştan yarı elastik/hibrit seton uygulaması yapılır. İlk 6-8 hafta gevşek uygulama ile olası enfeksiyon varlığ ıekarte edilir. Sonrasında duruma göre 2-4 haftada bir kısmı sıkmalarla ilerlenir. Tek ameliyatla ama uzun takip ve kontrol süreci içersinde sonlandırılır. Ama belli bir oranda kas hasarı olur. O yüzden bu hasarı tolere edebilecek hastalarda tercih edilir.