Kronik anal fissür tedavi algoritmasında, cerrahi dışı bir tedavi seçeneği olarak Botoks enjeksiyonu uygulaması yapılabilir. Ancak illa sonuç alınacak diye bir şart yoktur.
  Özellikle dışkılama sorunları olan ama bu sorunları normalmiş gibi kabul edip önemsemeyen kadınlarda botoks enjeksiyonu ile başarı elde etmek güçleşir.